97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5873 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  83.65 
 
 		 209 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  61.84 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  60 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  60 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  52.58 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  53.85 
 
 		 203 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  45.7 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  42.59 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  48.77 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  45.1 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  44.39 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  45.31 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  41.9 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  41.62 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  39.24 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  40.72 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  40.72 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  39.29 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  40.51 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  38.42 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  37.84 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  37.3 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  36.36 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  42.67 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  39.76 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  39.76 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  36.26 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  34.92 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  35.33 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  39.73 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  35.26 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  37.97 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  36.6 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  32.17 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  35.9 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  32.39 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  29.69 
 
 		 715 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  31.51 
 
 		 714 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  26.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.7 
 
 		 1018 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  28.79 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  26.42 
 
 		 716 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  24.61 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  30.41 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 1038 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.8 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  29.32 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  33.33 
 
 		 721 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.79 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.99 
 
 		 732 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  23.89 
 
 		 738 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  29.2 
 
 		 722 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  29.32 
 
 		 1042 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.52 
 
 		 1040 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  25.6 
 
 		 727 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.27 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  24.82 
 
 		 715 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.87 
 
 		 716 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.2 
 
 		 738 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  28 
 
 		 725 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  33.33 
 
 		 725 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.57 
 
 		 734 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.57 
 
 		 734 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  25.81 
 
 		 521 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  25.2 
 
 		 721 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.34 
 
 		 727 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  29.63 
 
 		 731 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  35.63 
 
 		 730 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  26.87 
 
 		 734 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  27.4 
 
 		 1675 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  29.03 
 
 		 741 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.95 
 
 		 728 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.86 
 
 		 727 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  24.14 
 
 		 731 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  26.47 
 
 		 716 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  26.24 
 
 		 748 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.81 
 
 		 736 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  32.47 
 
 		 724 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  28.79 
 
 		 719 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.83 
 
 		 727 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.53 
 
 		 759 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  30.85 
 
 		 906 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.89 
 
 		 1019 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  30.85 
 
 		 906 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.66 
 
 		 722 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf637  bacteriocin exporter and processing endoprotease C39  24.64 
 
 		 675 aa  43.9  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.66238  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  21.88 
 
 		 656 aa  43.5  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  27.78 
 
 		 739 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  38.81 
 
 		 760 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  35.59 
 
 		 738 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  27.69 
 
 		 297 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  26.32 
 
 		 695 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  35.71 
 
 		 747 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.03 
 
 		 908 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  27.86 
 
 		 771 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>