129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2091 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  46.7 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  48.02 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  48.02 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  47.14 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  49.07 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  42.67 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  41.78 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  43.36 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  46.22 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  46.22 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  39.83 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  41.38 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  41.38 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  40.72 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  39.69 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  38.86 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  38.07 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  35 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  37.43 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  38.38 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  37.02 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  39.73 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  38.69 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  36.72 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  37.42 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  43.28 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  36.32 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  38.31 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  38.31 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  43.1 
 
 		 427 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  32.65 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  30.9 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  32.6 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  34.51 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  35.56 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  30.22 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  29.22 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.78 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  30 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  29.75 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  28.32 
 
 		 728 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  28.87 
 
 		 715 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.19 
 
 		 1018 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.56 
 
 		 1018 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  27.16 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  26.52 
 
 		 724 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.17 
 
 		 727 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  28.67 
 
 		 714 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.59 
 
 		 695 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.64 
 
 		 1040 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 743 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  29.41 
 
 		 696 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.85 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.7 
 
 		 732 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.85 
 
 		 695 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.32 
 
 		 908 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  34.18 
 
 		 706 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.91 
 
 		 707 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  34.18 
 
 		 706 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  34.18 
 
 		 706 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  26.28 
 
 		 726 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  34.18 
 
 		 706 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  29.92 
 
 		 715 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.16 
 
 		 738 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  26.58 
 
 		 734 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  27.59 
 
 		 731 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.5 
 
 		 1019 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  28.18 
 
 		 1675 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.17 
 
 		 759 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  27.27 
 
 		 724 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 1038 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  35.79 
 
 		 683 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  26.76 
 
 		 727 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  28.03 
 
 		 707 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  27.27 
 
 		 724 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  25.29 
 
 		 1011 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  27.34 
 
 		 736 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  30.7 
 
 		 721 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  26.25 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  29.71 
 
 		 726 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.35 
 
 		 725 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  26.43 
 
 		 716 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  26.83 
 
 		 705 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.06 
 
 		 725 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  27.66 
 
 		 721 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  28.77 
 
 		 719 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  24.14 
 
 		 727 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.71 
 
 		 770 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  29.27 
 
 		 715 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  28.57 
 
 		 706 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.23 
 
 		 721 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>