58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0785 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 427 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2961  hypothetical protein  58.29 
 
 		 275 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0973815  normal  0.781678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1023  hypothetical protein  60.66 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  84.03 
 
 		 237 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  83.19 
 
 		 237 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  73.11 
 
 		 236 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0934  hypothetical protein  51.15 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0796593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  55.56 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  55.56 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  43.1 
 
 		 234 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  40.65 
 
 		 226 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  42.37 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  40.65 
 
 		 226 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  40.65 
 
 		 226 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  40.65 
 
 		 226 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  41.53 
 
 		 226 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  40.34 
 
 		 235 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  34.71 
 
 		 235 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  41.38 
 
 		 227 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  40.19 
 
 		 227 aa  93.2  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  40.19 
 
 		 227 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  39.13 
 
 		 203 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  41.12 
 
 		 234 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  39.32 
 
 		 237 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  35.54 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  32.1 
 
 		 253 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  37.17 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  33.56 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  32.88 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  38.26 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  39.09 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  35.9 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  36.07 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  36.13 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3434  hypothetical protein  35.65 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0556615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3088  hypothetical protein  35.65 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  34.82 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  34.19 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  33.33 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  30.4 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  31.03 
 
 		 244 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.07 
 
 		 1018 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  26.97 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.35 
 
 		 1717 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  28.81 
 
 		 715 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  26.85 
 
 		 731 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  31.01 
 
 		 719 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.42 
 
 		 1018 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  31.71 
 
 		 728 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.96 
 
 		 727 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 		 1038 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 1038 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  27.84 
 
 		 748 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.57 
 
 		 721 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  27.91 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25.99 
 
 		 1040 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  23.48 
 
 		 725 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>