56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0068 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  100 
 
 
199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  97.99 
 
 
198 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0096  peptidase family protein  97.67 
 
 
129 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  51.32 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0095  peptidase family protein  92.31 
 
 
67 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  30.71 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0129  peptidase family protein  87.18 
 
 
37 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  26.7 
 
 
235 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  28.32 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  27.51 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  26.24 
 
 
238 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  28.67 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  26.19 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  26.24 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  28.48 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  30.28 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  26.95 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  26.19 
 
 
237 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  29.11 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  29.81 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  28.67 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  28.57 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  25.87 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  26.9 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  23.81 
 
 
234 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  28.77 
 
 
266 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.78 
 
 
727 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  26.06 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 
716 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  28.17 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  28.82 
 
 
225 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  26.76 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.95 
 
 
1019 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  23.65 
 
 
760 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  23.13 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  23.13 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  24.68 
 
 
1038 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  28.68 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  25.52 
 
 
226 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  25.52 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  24.05 
 
 
1038 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  25.52 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  25 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.52 
 
 
737 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  25.16 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  27.59 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  24.11 
 
 
608 aa  45.1  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  25.38 
 
 
731 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.66 
 
 
738 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  25.3 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  25.17 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  24.46 
 
 
726 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  26.17 
 
 
738 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  22.3 
 
 
734 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  22.3 
 
 
734 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>