60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2150 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  36.36 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  26.7 
 
 
266 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  29.32 
 
 
226 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  30.3 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  28.57 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  29.1 
 
 
251 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  29.1 
 
 
253 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  29.1 
 
 
253 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  30 
 
 
234 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  28.79 
 
 
232 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  33.33 
 
 
733 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  29.03 
 
 
234 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  30.53 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  28.57 
 
 
237 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  27.48 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  29.01 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  29.01 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  28.57 
 
 
237 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  29.01 
 
 
251 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  32.79 
 
 
719 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  27.41 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  28.89 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  26.11 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  28.15 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30.71 
 
 
707 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 
707 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  29.85 
 
 
261 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  30.25 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  28.18 
 
 
726 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  28.15 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  31.34 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  26.72 
 
 
236 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  25 
 
 
223 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  27.54 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.83 
 
 
724 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.27 
 
 
1018 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  24.81 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  24.36 
 
 
731 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  29.69 
 
 
704 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
728 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  30.11 
 
 
328 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  30.89 
 
 
696 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.2 
 
 
715 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  29.69 
 
 
704 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  25.62 
 
 
297 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.69 
 
 
704 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  25.4 
 
 
716 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.93 
 
 
725 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.94 
 
 
536 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  34.15 
 
 
908 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  26.09 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.93 
 
 
908 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  27.21 
 
 
238 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  27.21 
 
 
238 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  25.62 
 
 
1018 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  31.86 
 
 
705 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  27.87 
 
 
704 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.14 
 
 
1018 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  28.83 
 
 
427 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>