86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0894 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 328 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  30.32 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  31.02 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.29 
 
 		 216 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  29.67 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  29.67 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.43 
 
 		 232 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.43 
 
 		 232 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.43 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.43 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  31.32 
 
 		 575 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  35.09 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.93 
 
 		 216 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  29.67 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.93 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.43 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 216 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.34 
 
 		 248 aa  95.9  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.64 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  29.74 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  31.64 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.86 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  30.1 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  29.55 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  28.16 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  29.06 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  28.27 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  27.35 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.05 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  28.96 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  27.5 
 
 		 226 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  29.57 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  30.73 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  27.36 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  28.18 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  34.05 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  26.6 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  26.37 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  28.89 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  26.92 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  28.14 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  26.92 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  33.59 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  25.26 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.59 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  29.05 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.6 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  28.64 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  27.87 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  29.44 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  29.29 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  34.46 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.44 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  31.85 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  27.43 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  29.24 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  28.65 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  28.33 
 
 		 188 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  27.87 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  26.29 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  27.89 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  27.72 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  31.88 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0773  peptidase C39 bacteriocin processing  34.91 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  28.27 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.22 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  24.7 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  28.12 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  28.12 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  23.51 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  30.6 
 
 		 509 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  28.27 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  37.5 
 
 		 716 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  30.53 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  22.88 
 
 		 606 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  33.33 
 
 		 727 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  23.15 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  33.64 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  31.43 
 
 		 455 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  30.11 
 
 		 186 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  22.11 
 
 		 199 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.26 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>