62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49409 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  100 
 
 
606 aa  1261    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  42.18 
 
 
537 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  29.12 
 
 
226 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  31.35 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  28.25 
 
 
230 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  29.32 
 
 
328 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  29.29 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  27.98 
 
 
309 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  27.69 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  28.63 
 
 
330 aa  77  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  26.56 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  30.39 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  26.1 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  26.81 
 
 
254 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  25 
 
 
193 aa  64.3  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  28.09 
 
 
305 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  25 
 
 
216 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25 
 
 
232 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.58 
 
 
216 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25 
 
 
232 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.85 
 
 
232 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  25 
 
 
216 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.85 
 
 
216 aa  60.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  25 
 
 
216 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  24.15 
 
 
216 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  24.58 
 
 
216 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  26.67 
 
 
279 aa  57.4  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  26.07 
 
 
302 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  26.63 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  25.88 
 
 
300 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
293 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  25.52 
 
 
584 aa  53.9  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  24.36 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  24.07 
 
 
378 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  24.21 
 
 
348 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  24.9 
 
 
287 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  23.01 
 
 
289 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  24.21 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  24.89 
 
 
296 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  27.62 
 
 
427 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  24.08 
 
 
288 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  26.53 
 
 
289 aa  51.2  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  25.7 
 
 
225 aa  50.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  23.83 
 
 
309 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  24.08 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  24.18 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  23.43 
 
 
269 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  22.73 
 
 
188 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  28.57 
 
 
509 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50514  predicted protein  26.82 
 
 
674 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  23.21 
 
 
257 aa  48.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  22.88 
 
 
328 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  23.55 
 
 
294 aa  47.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  24.87 
 
 
248 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  25.57 
 
 
213 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  23.83 
 
 
296 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  25.57 
 
 
213 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  23.85 
 
 
289 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  24.19 
 
 
474 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  26.62 
 
 
268 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  24.12 
 
 
478 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>