85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3273 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  1005    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.37 
 
 		 263 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  45.32 
 
 		 211 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  37.37 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  42.78 
 
 		 257 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  39.8 
 
 		 218 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  40.62 
 
 		 234 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55162  predicted protein  38.3 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662149  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54643  predicted protein  39.89 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50055  predicted protein  39.89 
 
 		 430 aa  124  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.83 
 
 		 232 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.83 
 
 		 216 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49425  predicted protein  34.24 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.27 
 
 		 216 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.27 
 
 		 232 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.27 
 
 		 216 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  27.78 
 
 		 296 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.27 
 
 		 216 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  25.96 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49426  predicted protein  34.81 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.15 
 
 		 216 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.27 
 
 		 232 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44141  predicted protein  34.08 
 
 		 715 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.15 
 
 		 216 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  33.15 
 
 		 216 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  32.34 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  33.05 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  26.98 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47410  predicted protein  34.57 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  26.26 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  25.53 
 
 		 289 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  35.6 
 
 		 255 aa  97.8  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  27.4 
 
 		 277 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  25.94 
 
 		 295 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  26.21 
 
 		 292 aa  96.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  32.98 
 
 		 248 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  25.87 
 
 		 268 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  30.28 
 
 		 330 aa  94  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  34.64 
 
 		 269 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  30.77 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  26.86 
 
 		 309 aa  90.1  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  28.51 
 
 		 282 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  30.41 
 
 		 226 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  24.73 
 
 		 294 aa  86.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  33.8 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  32.04 
 
 		 188 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  26.86 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  28.96 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  37.61 
 
 		 327 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  28.96 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  32.02 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  35.62 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  26.88 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.9 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  29.13 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  29.44 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  27.19 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  30.73 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.86 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  26.98 
 
 		 199 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  27.35 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  28.34 
 
 		 193 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  31.47 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  25.14 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  31.72 
 
 		 508 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  23.58 
 
 		 225 aa  57  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  31.14 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  28.02 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  26.21 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  28.33 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  28.33 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1498  hypothetical protein  32.38 
 
 		 196 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00731295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  27.74 
 
 		 137 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  54.05 
 
 		 235 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  55.56 
 
 		 232 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  24.12 
 
 		 606 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>