82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2091 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  68.23 
 
 
287 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  62.23 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  59.79 
 
 
289 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  59.93 
 
 
289 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  58.42 
 
 
279 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  53.92 
 
 
294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  50.89 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  45.65 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  45.59 
 
 
293 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  46.32 
 
 
282 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  42.05 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  43.31 
 
 
305 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  41.89 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  43.01 
 
 
288 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  40 
 
 
295 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  41.88 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  39.02 
 
 
296 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  35.48 
 
 
268 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  39.35 
 
 
216 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  39.81 
 
 
216 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  39.35 
 
 
216 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  39.35 
 
 
232 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  39.35 
 
 
216 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  39.35 
 
 
216 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.35 
 
 
232 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  38.43 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.89 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  37.5 
 
 
216 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  41.21 
 
 
248 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  40 
 
 
575 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  38.39 
 
 
330 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  41.18 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  37.86 
 
 
255 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  34.41 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.75 
 
 
213 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  35.75 
 
 
213 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.97 
 
 
376 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  33.18 
 
 
317 aa  105  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  33 
 
 
254 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  30.83 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.24 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  32.45 
 
 
257 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  33.01 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  34.76 
 
 
416 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  32.49 
 
 
188 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.82 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  34.04 
 
 
427 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  30.89 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  29.13 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  27.78 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  31.09 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  29.05 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  28.64 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  27.1 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  30.58 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  30.41 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  27.23 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  32.57 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  30.9 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  29.82 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  30.88 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  29.05 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  29.05 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  31.15 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  37.17 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.29 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  36.11 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  36.11 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  36.11 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  30.14 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  30.6 
 
 
509 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  28.85 
 
 
431 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  27.78 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  31.47 
 
 
137 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  27.49 
 
 
537 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  26.04 
 
 
193 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  23.85 
 
 
606 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  31.4 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  36.36 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  31.71 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  29.75 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>