53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2488 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 231 aa  487  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  79.74 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  77.06 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  77.63 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  77.06 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  77.06 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  78.07 
 
 		 231 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  78.51 
 
 		 231 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  78.51 
 
 		 231 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  76.62 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  74.89 
 
 		 231 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  75.33 
 
 		 230 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  74.89 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  75 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  73.25 
 
 		 230 aa  357  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  69.3 
 
 		 231 aa  342  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  50.44 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  51.54 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.93 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  40.35 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  40.27 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  31.17 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  40.82 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  40.82 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  36.79 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  39.8 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  39.05 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  27.68 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  35.45 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  36 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  26.78 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  32.69 
 
 		 296 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.83 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  32.63 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  31.13 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  31.71 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  37.14 
 
 		 575 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  31.4 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  38.89 
 
 		 427 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  29.31 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  31.36 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  34.85 
 
 		 378 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.95 
 
 		 216 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.95 
 
 		 216 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.95 
 
 		 232 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.95 
 
 		 232 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  29.31 
 
 		 289 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.95 
 
 		 216 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.95 
 
 		 232 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.33 
 
 		 216 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  30.95 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.95 
 
 		 216 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>