31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2216 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  77.99 
 
 
209 aa  348  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  75.36 
 
 
207 aa  333  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  74.52 
 
 
209 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  74.04 
 
 
209 aa  332  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  73.68 
 
 
213 aa  332  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  71.29 
 
 
210 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  68.9 
 
 
210 aa  314  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  69.71 
 
 
210 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.04 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  39.6 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  27.68 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  28.44 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  29.66 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  27.32 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.8 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.8 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  37.38 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.7 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.25 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  29.07 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  28.25 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.25 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  27.31 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  37.27 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.25 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  37.37 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  43.01 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  35.35 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  38.71 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.267459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>