50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1578 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 231 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 231 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  96.1 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  94.37 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  88.21 
 
 		 231 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  88.21 
 
 		 231 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  87.77 
 
 		 231 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  87.01 
 
 		 231 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  87.77 
 
 		 231 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  82.82 
 
 		 230 aa  407  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  79.48 
 
 		 230 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  77.49 
 
 		 231 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  77.53 
 
 		 230 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  76.21 
 
 		 235 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  78.51 
 
 		 231 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  75.11 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  50.44 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  49.78 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.26 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  39.04 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  39.37 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  31.72 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  26.79 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  41.3 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  41.3 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  36.36 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  35.35 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  27.8 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  25.56 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  36.19 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  32.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.97 
 
 		 376 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  35.14 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  38.57 
 
 		 575 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  32.69 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  33.33 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  33.33 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.33 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.33 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  33.78 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  34.78 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  32.14 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  35.44 
 
 		 455 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>