26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48417 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  100 
 
 
455 aa  946    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00720  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
501 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629397  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31219  predicted protein  46.98 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00425878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.29 
 
 
259 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1322  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.6 
 
 
261 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47513  predicted protein  42.65 
 
 
717 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  29.56 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  35.04 
 
 
210 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  27.27 
 
 
241 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.112929 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01676  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
279 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 
327 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04986  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  0.525699 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  28.57 
 
 
193 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  26.63 
 
 
277 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.85 
 
 
231 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  41.18 
 
 
327 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.18 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  31.43 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.78 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  24.12 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 
230 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  27.85 
 
 
235 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  35.29 
 
 
235 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  28.97 
 
 
231 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>