18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54622 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  100 
 
 
241 aa  503  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.112929 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04986  conserved hypothetical protein  39.17 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  0.525699 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  32.04 
 
 
210 aa  99  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  29.61 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02010  expressed protein  28.51 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.83 
 
 
259 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  27.27 
 
 
455 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1322  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.79 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31219  predicted protein  31.58 
 
 
493 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00425878  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00720  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
501 aa  50.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629397  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  31.73 
 
 
347 aa  48.5  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01676  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  30.84 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.95 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  24.76 
 
 
305 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  35.24 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  36.19 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  31.78 
 
 
289 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>