102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3712 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  58.42 
 
 		 309 aa  334  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  61.65 
 
 		 279 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  56.74 
 
 		 289 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  56.74 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  57.93 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  55.87 
 
 		 287 aa  308  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  50.89 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  46.07 
 
 		 282 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  44.93 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  45.13 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  42.05 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  40.48 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  42.4 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  48.28 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  40.21 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  49.27 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  48.8 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  33.81 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44.44 
 
 		 216 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  44.44 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.94 
 
 		 232 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  43.94 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  43.94 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.94 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  43.94 
 
 		 216 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  42.42 
 
 		 216 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  42.93 
 
 		 216 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  42.42 
 
 		 216 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  40 
 
 		 575 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40.96 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  39.34 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  37.61 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  35.61 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  35.75 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  34.6 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  31.77 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.33 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.33 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  33.18 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  31.75 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  27.4 
 
 		 478 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  33.16 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  36.31 
 
 		 416 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  31.37 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.15 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  33.16 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.52 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  28.96 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  31.55 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  39.23 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  30.11 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  37.01 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  37.01 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  37.01 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  30 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  29.9 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  29.15 
 
 		 474 aa  79.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  29.38 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  27.49 
 
 		 508 aa  79  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.81 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  36.64 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  30.62 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  35.25 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  29.19 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.57 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  29.75 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  26.32 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  28.97 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  35.94 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  34.65 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  34.48 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  25.84 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  32.52 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.78 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  25 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  25.62 
 
 		 193 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  24.18 
 
 		 606 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  26.02 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  26.63 
 
 		 455 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  28.26 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.84 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31846  predicted protein  25.56 
 
 		 552 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  30.84 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.84 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.84 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  30.84 
 
 		 241 aa  45.8  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  31.78 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  30.51 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  34.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  36.23 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>