82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3293 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
289 aa  590  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  98.96 
 
 
289 aa  583  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  74.56 
 
 
309 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  67.38 
 
 
294 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  62.63 
 
 
287 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  61.13 
 
 
279 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  59.93 
 
 
289 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  56.74 
 
 
277 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  42.4 
 
 
292 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  43.9 
 
 
289 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  41.61 
 
 
295 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  43.01 
 
 
282 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  42.27 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  41.9 
 
 
305 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  40.93 
 
 
288 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  40.57 
 
 
288 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  40.97 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  37.24 
 
 
296 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  32.38 
 
 
268 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  39.11 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  39.59 
 
 
216 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  38.83 
 
 
216 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  39.59 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  38.83 
 
 
232 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.11 
 
 
232 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.83 
 
 
232 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  39.11 
 
 
216 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  42.63 
 
 
575 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  39.11 
 
 
216 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  38.61 
 
 
216 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  42.39 
 
 
248 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  38.67 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  37.62 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 
269 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  34.63 
 
 
255 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.69 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  33.33 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  30.48 
 
 
254 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.68 
 
 
277 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  33.01 
 
 
302 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  32.02 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.38 
 
 
213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  31.38 
 
 
213 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 
416 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  32.09 
 
 
188 aa  92.8  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  31.78 
 
 
417 aa  92.4  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  35.2 
 
 
218 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  31.75 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  37.69 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 
211 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  30.77 
 
 
427 aa  86.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.64 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  29.81 
 
 
474 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  26.92 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  30 
 
 
584 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  28.77 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  29.74 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  28.77 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  28.96 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  34.82 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  34.82 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  27.62 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  34.82 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  29.41 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  34.19 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.56 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  29.81 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  28.1 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  27.98 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  26.9 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  29.1 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  33.1 
 
 
509 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  28.46 
 
 
431 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  27.49 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  31.65 
 
 
137 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  26.53 
 
 
606 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  32.06 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31846  predicted protein  24.6 
 
 
552 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  25.1 
 
 
537 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  25.41 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  26.45 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>