63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5289 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.65 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  35.33 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04986  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  0.525699 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31219  predicted protein  32.52 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00425878  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  29.56 
 
 		 455 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  29.61 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1322  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.78 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01676  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  28.27 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.78 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.78 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  26.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  26.23 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.78 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  26.23 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.23 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.23 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.23 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  36.94 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.23 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  28.29 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  28.29 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  28.29 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.51 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  28.42 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  30.13 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  32.74 
 
 		 327 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00720  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 501 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  28.42 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  29.67 
 
 		 378 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  28.87 
 
 		 474 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  26.63 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  25.62 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  26.77 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47513  predicted protein  31.65 
 
 		 717 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  25.74 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  27.32 
 
 		 328 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  33.02 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  31.91 
 
 		 330 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  30.19 
 
 		 431 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  27.08 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  32.17 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  27 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  27.51 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  26.04 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  27.88 
 
 		 584 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  27.04 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  27.33 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02010  expressed protein  32.26 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44433  predicted protein  34.02 
 
 		 449 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580101  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  26.67 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  25.93 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  38.16 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  38.16 
 
 		 348 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  25.4 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  26.71 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  28.1 
 
 		 325 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  28.31 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  28.65 
 
 		 257 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  27.37 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 416 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>