12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0884 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 		 259 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1322  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  66.27 
 
 		 261 aa  360  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  35.29 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31219  predicted protein  32.77 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00425878  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00720  conserved hypothetical protein  31.22 
 
 		 501 aa  101  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  33.65 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47513  predicted protein  31.3 
 
 		 717 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  31.19 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  27.83 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.112929 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01676  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  26.26 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  31.09 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>