13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1322 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1322  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  100 
 
 
261 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0884  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  66.27 
 
 
259 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  34.6 
 
 
455 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31219  predicted protein  32.17 
 
 
493 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00425878  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00720  conserved hypothetical protein  29.39 
 
 
501 aa  102  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.629397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  29.78 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47513  predicted protein  27.53 
 
 
717 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54622  predicted protein  26.79 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  26 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04986  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  0.525699 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  23.45 
 
 
508 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01676  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  23.74 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>