74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2573 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  57.73 
 
 		 218 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  53.69 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  41.2 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  41.88 
 
 		 277 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  41.8 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  40.62 
 
 		 478 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  30.59 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  34.76 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  35.6 
 
 		 293 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  33.16 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  34.22 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  39.69 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  31.22 
 
 		 575 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.14 
 
 		 324 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  28.36 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  30.6 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.43 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  36.64 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.17 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  27.22 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  28.5 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.78 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.67 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  30.05 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  27.78 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  32.02 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  27.78 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  27.78 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.78 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.78 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  27.87 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  30.88 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  27.78 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  33.79 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  27.22 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  28.95 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  30.81 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  29.63 
 
 		 309 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.42 
 
 		 292 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  29.28 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  29.1 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  29.1 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.78 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  31.15 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  36.8 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  28.11 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  28.32 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  28.49 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  25.24 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  26.52 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  24.51 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  26.32 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  27.23 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  26.8 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  25.26 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  25 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  33.33 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  33.33 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  27.41 
 
 		 584 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  25.76 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  26.37 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.08 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  25.12 
 
 		 473 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  24.16 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  34.31 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  23.79 
 
 		 508 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  25.62 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  30.7 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  28.57 
 
 		 417 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  27.37 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>