90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2795 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  100 
 
 		 575 aa  1179    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  43.58 
 
 		 269 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  41.79 
 
 		 309 aa  157  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  42.41 
 
 		 289 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  42.63 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1705  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  40 
 
 		 277 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  39.79 
 
 		 282 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  39.82 
 
 		 287 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  41.9 
 
 		 248 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  38.34 
 
 		 294 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  39.38 
 
 		 293 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  38.81 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  37.77 
 
 		 292 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  39.79 
 
 		 289 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  39.27 
 
 		 288 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  38.1 
 
 		 268 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  39.27 
 
 		 288 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  37.23 
 
 		 295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  38.3 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  37.57 
 
 		 305 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  40.74 
 
 		 188 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.41 
 
 		 216 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.87 
 
 		 216 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.87 
 
 		 216 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.17 
 
 		 213 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  36.17 
 
 		 213 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.87 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  36.07 
 
 		 296 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.87 
 
 		 232 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  33.87 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.87 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  33.87 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  33.02 
 
 		 226 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  32.88 
 
 		 254 aa  104  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.25 
 
 		 277 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  32.34 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  34.72 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  30.53 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  31.32 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  30.57 
 
 		 257 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  30.99 
 
 		 330 aa  97.1  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.33 
 
 		 263 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  32.46 
 
 		 328 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 218 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  32.47 
 
 		 225 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  33.33 
 
 		 584 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 327 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 327 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 327 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  30.92 
 
 		 302 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.67 
 
 		 324 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  34.3 
 
 		 474 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  30.73 
 
 		 255 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  40.15 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  31.22 
 
 		 234 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.44 
 
 		 376 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 211 aa  87.4  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  32.31 
 
 		 199 aa  87  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  29.7 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  32.19 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  31.6 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  29.46 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  27.35 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  27.42 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  40.32 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  31.12 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  28.51 
 
 		 230 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  26.17 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  27.91 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  28.91 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  26.32 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  38.18 
 
 		 347 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  27.02 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  24.36 
 
 		 606 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  30.14 
 
 		 137 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.9 
 
 		 231 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 231 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  38.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 230 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  37.14 
 
 		 235 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  38.57 
 
 		 231 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 		 231 aa  43.9  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>