79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34321 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  100 
 
 
302 aa  630  1e-180  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.98 
 
 
216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.18 
 
 
232 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.48 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.18 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.18 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.18 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.18 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.67 
 
 
216 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  34.18 
 
 
216 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.16 
 
 
216 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  33.48 
 
 
309 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  33.18 
 
 
277 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  31.85 
 
 
328 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  33.01 
 
 
289 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  32.85 
 
 
289 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  30.92 
 
 
575 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  28.22 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  31.46 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  30.77 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  31.9 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  29.02 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  30.48 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  30.09 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  32.43 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  28.79 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  32.7 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  27.31 
 
 
269 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  31.75 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  31.28 
 
 
288 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  31.73 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  29.18 
 
 
584 aa  85.9  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  27.47 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.65 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.64 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  29.74 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  28.77 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.92 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  33.63 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  27.73 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  32.21 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  27.49 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  28.57 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  28.57 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  28.57 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  26.29 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.76 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.76 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  29.76 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  28.44 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  31.47 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  28.63 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  27.85 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.3 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  31.33 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  31.33 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  31.33 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  28.64 
 
 
431 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  25.98 
 
 
193 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  26.7 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  26.82 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  25.12 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  33.09 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  32.59 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  28.29 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  27.18 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  29.08 
 
 
416 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  26.17 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  26.17 
 
 
606 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  24.51 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49327  predicted protein  25.72 
 
 
360 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31846  predicted protein  24 
 
 
552 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33208  predicted protein  23 
 
 
210 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0700381  normal  0.093533 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  21.86 
 
 
417 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  27.74 
 
 
509 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  29.61 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04986  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 
255 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal  0.525699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>