61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44168 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  100 
 
 		 431 aa  887    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  34.77 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  34.96 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  34.76 
 
 		 188 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  32.77 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  37.75 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  31.13 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  30.95 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  26.1 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  26.59 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  28.29 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  30.04 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  28.71 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.99 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  27.27 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  26.83 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  25.83 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  28.64 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  29.22 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  26.17 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  29.67 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  27.54 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  28.57 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  32.28 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  28.46 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  23.53 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  28.85 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  23.53 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  26.57 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  28.43 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  28.46 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  26.21 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.11 
 
 		 232 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  25.11 
 
 		 216 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.53 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  28.99 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  24.23 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  23.45 
 
 		 216 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.11 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.11 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  25.41 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  26.76 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  27.14 
 
 		 279 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  25.6 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  24.41 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  28.02 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  28.27 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  22.12 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  26.89 
 
 		 248 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  24.55 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  24.55 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49327  predicted protein  30.67 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  29.29 
 
 		 199 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5289  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  27.62 
 
 		 193 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  27.62 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  25.89 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  27.75 
 
 		 584 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  23.5 
 
 		 226 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.64 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.45 
 
 		 277 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>