80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5409 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  100 
 
 		 295 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  92.2 
 
 		 292 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  69.05 
 
 		 305 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  44.79 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  41.61 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  41.61 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  42.27 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  41.11 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  40.7 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  42.31 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  41.32 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  40.28 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  41.67 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  40 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  42.27 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  41.26 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  41.26 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  36.39 
 
 		 268 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  44.02 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  44.02 
 
 		 216 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  43.54 
 
 		 216 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  43.54 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  43.54 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  43.54 
 
 		 216 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  43.06 
 
 		 216 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  43.54 
 
 		 216 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  42.58 
 
 		 216 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  41.63 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  37.23 
 
 		 575 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  37.93 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  34.7 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  35.71 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.67 
 
 		 376 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  26.99 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.93 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  27.72 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  30.56 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  34.57 
 
 		 213 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  34.57 
 
 		 213 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  29.44 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  31.37 
 
 		 226 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  28.85 
 
 		 254 aa  93.2  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  30.48 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  29.84 
 
 		 416 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  31.22 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  29.08 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  25.26 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  27.73 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  29.81 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  30.61 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  29 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  30.81 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  28.64 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.57 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  26.56 
 
 		 606 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  29.47 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  29.3 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  29.15 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  32.87 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  25.39 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  28.37 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  28.37 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.56 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  27.91 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  26.21 
 
 		 431 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  26.73 
 
 		 537 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  32.48 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.19 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  27.46 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  29.5 
 
 		 137 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  30.53 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>