44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44137 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  100 
 
 		 537 aa  1121    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  41.51 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  28.57 
 
 		 226 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  32.26 
 
 		 254 aa  87  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  31.09 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  27.27 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  33.13 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  27.82 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  25.93 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  30.72 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  25.74 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.53 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  28.34 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.15 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  26.23 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  26.23 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  24.15 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  27.39 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  53.33 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.04 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  24.04 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  24.04 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.04 
 
 		 232 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.04 
 
 		 216 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  25.6 
 
 		 294 aa  57  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.04 
 
 		 216 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  26.04 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  23.53 
 
 		 193 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  27.02 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  23.56 
 
 		 216 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  26.73 
 
 		 295 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  24.79 
 
 		 292 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  25.59 
 
 		 305 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  24.41 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  25.31 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  27.49 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  25 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  26.29 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  22.62 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  25.1 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  22.03 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  25.82 
 
 		 282 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  27.98 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>