62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42426 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  100 
 
 		 473 aa  990    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  41.19 
 
 		 417 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44320  predicted protein  29.94 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  31.6 
 
 		 279 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  27.59 
 
 		 287 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  31.9 
 
 		 282 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  30.28 
 
 		 294 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  32 
 
 		 289 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  31.75 
 
 		 293 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  30.65 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 		 309 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  30.65 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  30.77 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  30 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  27.62 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  27.62 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  30.58 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.98 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  30.29 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  27.41 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  27.62 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  29.81 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.44 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  28.37 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  28.04 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  28.85 
 
 		 216 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  27.1 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  28.85 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  28.57 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  28.85 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  34.38 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.85 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  34.38 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  30.7 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  28.85 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.85 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.5 
 
 		 232 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  26.64 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  27.91 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  28.77 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  23.9 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  26.15 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  24.77 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  27.18 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  23.51 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  23.02 
 
 		 263 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  24.39 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  24.5 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  34.21 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  34.21 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  34.21 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  26.51 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  25.12 
 
 		 234 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  23.44 
 
 		 211 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  23.47 
 
 		 218 aa  46.6  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  22.86 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.58 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  35.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  30.26 
 
 		 327 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  25.88 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  24.78 
 
 		 230 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  23.56 
 
 		 269 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>