59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2350 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 231 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  78.51 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  77.49 
 
 		 231 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  77.49 
 
 		 231 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  77.83 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  77.19 
 
 		 231 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  76.65 
 
 		 230 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  75.32 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  74.89 
 
 		 231 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  74.89 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  75.32 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  75.44 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  73.48 
 
 		 235 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  74.89 
 
 		 231 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  73.13 
 
 		 230 aa  364  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  69.13 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  50.44 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  48.9 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  47.58 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  39.47 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  38.91 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  33.63 
 
 		 199 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  40.59 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  38.32 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  40.59 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  36.94 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  36.63 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  25.75 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  35.64 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  28.89 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  33.66 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  29.63 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  29.25 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.52 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  31 
 
 		 427 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.52 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.52 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.52 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  40 
 
 		 575 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  34.52 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  32.58 
 
 		 378 aa  45.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  30.51 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  28.97 
 
 		 455 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  29.75 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  28.81 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  31.43 
 
 		 474 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  26.85 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  33.65 
 
 		 478 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  28.81 
 
 		 289 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  36.62 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>