54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2503 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  100 
 
 
231 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  97.84 
 
 
231 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  97.84 
 
 
231 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  97.4 
 
 
231 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  90.04 
 
 
231 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  87.77 
 
 
231 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  87.77 
 
 
231 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  87.01 
 
 
231 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  86.15 
 
 
231 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  82.1 
 
 
230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  77.83 
 
 
230 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  77.09 
 
 
230 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  75.65 
 
 
235 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  74.89 
 
 
231 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  77.06 
 
 
231 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  72.93 
 
 
231 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  50.88 
 
 
232 aa  244  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  48.02 
 
 
235 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  47.14 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  40.97 
 
 
235 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  41.18 
 
 
239 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  40.22 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  38.38 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  25.89 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  36.36 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  37.37 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  36.19 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  28.25 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  35.64 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  26.01 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  39.19 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  30.28 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.84 
 
 
376 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.52 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.52 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  34.52 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.52 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.52 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  30.84 
 
 
277 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.52 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  34.52 
 
 
216 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  33.33 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48417  predicted protein  27.78 
 
 
455 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  37.14 
 
 
575 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  23.96 
 
 
327 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  36.76 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  23.96 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  23.96 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  35.21 
 
 
211 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>