31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2561 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  431  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  75.36 
 
 
216 aa  333  7e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  71.9 
 
 
213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  71.77 
 
 
209 aa  325  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  71.29 
 
 
209 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  69.38 
 
 
210 aa  313  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  68.9 
 
 
210 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  69.9 
 
 
209 aa  311  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  67.94 
 
 
210 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.32 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  39.05 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  36.28 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  38.32 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  39.05 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  29.51 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  38.1 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  40.22 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  35.96 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  41.94 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  36.19 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.19 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  29.02 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.267459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>