66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0816 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  31.82 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  32.88 
 
 		 230 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  32.86 
 
 		 235 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  33.63 
 
 		 231 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  31.28 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  31.53 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  31.17 
 
 		 231 aa  91.7  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.81 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.81 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  33.81 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.33 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.16 
 
 		 231 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  30.97 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.56 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  30.94 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.72 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.72 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  31.43 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  29.51 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  28.64 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  28.14 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  31.28 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  37.23 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  41.05 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  40.4 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  26.88 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  36.08 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  30.77 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.27 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  36.36 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  29.41 
 
 		 584 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  24.39 
 
 		 376 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  35.71 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.31 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  27.12 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.29 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.7 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  25.7 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  26.14 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  26.14 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  32.86 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.86 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  32.86 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  27.56 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.86 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  26.67 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  34.29 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  26.99 
 
 		 378 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  26.85 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  34.31 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  32.39 
 
 		 427 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  31.11 
 
 		 268 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  29.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  22.11 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  26.45 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  23.2 
 
 		 296 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  29.21 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  29.59 
 
 		 287 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  29.03 
 
 		 305 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.39 
 
 		 324 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>