34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  54.55 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  42.53 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  42.79 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  41.18 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.82 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.63 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  41.63 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  41.63 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  41.18 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  39.37 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.82 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.37 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.37 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  38.91 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  40.27 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  39.82 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  39.82 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  39.82 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  38.91 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.1 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  30.94 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  41.3 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  40.22 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  39.78 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  39.78 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  39.78 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  29.02 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  36.56 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  38.71 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  37.63 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  38.1 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  38.1 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  38.1 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>