48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00218 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00218  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
232 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0144  2OG-Fe(II) oxygenase  62.72 
 
 
235 aa  318  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  51.3 
 
 
230 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1789  hypothetical protein  52.42 
 
 
235 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1540  hypothetical protein  50.88 
 
 
230 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1722  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  50.88 
 
 
231 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1944  hypothetical protein  50.44 
 
 
231 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1653  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  50.44 
 
 
231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135174  hitchhiker  0.000299116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1578  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  50.44 
 
 
231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1744  2OG-Fe(II) oxygenase  49.34 
 
 
231 aa  248  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00889907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2488  2OG-Fe(II) oxygenase  50.44 
 
 
231 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  50.44 
 
 
231 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  50.88 
 
 
231 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2503  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  50.88 
 
 
231 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  50.88 
 
 
231 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  50.88 
 
 
231 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  51.3 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2257  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  49.56 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  48.47 
 
 
231 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0019  hypothetical protein  40.53 
 
 
235 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000280504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18190  2OG-Fe(II) oxygenase superfamily enzyme  42.79 
 
 
239 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.267459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  31.82 
 
 
199 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1039  trypsin  38.6 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19111  hypothetical protein  38.53 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.425408  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15781  trypsin  36.11 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0729491  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2561  hypothetical protein  35.96 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1513  trypsin-like  35.19 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.23257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2216  hypothetical protein  37.27 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0991364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05171  mannitol dehydrogenase  35.35 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12021  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.187353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2025  trypsin  35.35 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000521243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.43 
 
 
376 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  24.89 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.89 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  35.21 
 
 
474 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  24.44 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  26.45 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  30.28 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  42.59 
 
 
427 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  55.56 
 
 
478 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.94 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.94 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.44 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24.44 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  24.44 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  32.94 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  24 
 
 
216 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>