12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50514 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50514  predicted protein  100 
 
 
674 aa  1408    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  28.8 
 
 
508 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  39.18 
 
 
230 aa  97.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  33.74 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  29.55 
 
 
509 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  25.81 
 
 
255 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  39.62 
 
 
309 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  26.82 
 
 
606 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  25.73 
 
 
378 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  29.2 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  26.82 
 
 
268 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  22.62 
 
 
584 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>