17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0773 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0773  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5247  peptidase C39 bacteriocin processing  50.62 
 
 		 542 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  34.91 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  25.93 
 
 		 715 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.91 
 
 		 1018 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.06 
 
 		 1018 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1688  Vitamin K epoxide reductase  27.83 
 
 		 547 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559526  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  33.33 
 
 		 738 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  34.18 
 
 		 716 aa  47.4  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.45 
 
 		 741 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  36.05 
 
 		 1038 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  36.05 
 
 		 1038 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.83 
 
 		 1018 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.36 
 
 		 1042 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  31.58 
 
 		 739 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  21.37 
 
 		 760 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.32 
 
 		 1040 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>