41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2878 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.37 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  30.5 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.86 
 
 		 727 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.17 
 
 		 734 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.17 
 
 		 734 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.77 
 
 		 727 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.43 
 
 		 725 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  28.57 
 
 		 521 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.64 
 
 		 727 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  28.89 
 
 		 721 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.08 
 
 		 722 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  25.61 
 
 		 736 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.81 
 
 		 721 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  27.21 
 
 		 715 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.26 
 
 		 738 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.32 
 
 		 716 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  28.06 
 
 		 1717 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.12 
 
 		 738 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  25.83 
 
 		 715 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  26.85 
 
 		 737 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  28.1 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  26.92 
 
 		 1675 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  24.82 
 
 		 714 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.15 
 
 		 715 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  26.24 
 
 		 719 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  26.09 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  26.56 
 
 		 724 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  26.56 
 
 		 724 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  25.29 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  25.83 
 
 		 731 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  24.37 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  25.19 
 
 		 731 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.29 
 
 		 759 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  28.06 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  26.97 
 
 		 724 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  25.62 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  29.03 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  27.81 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  27.84 
 
 		 1681 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  26.35 
 
 		 748 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>