More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1545 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1545  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  85.98 
 
 		 224 aa  273  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 232 aa  94.4  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 245 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 235 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.93 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  34.16 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.67 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.38 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 240 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  29.14 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  25.16 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  25.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  22.22 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>