More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0247 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0247  type I secretion system ATPase  100 
 
 
571 aa  1141    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0276  type I secretion system ATPase  94.22 
 
 
571 aa  1060    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3974  type I secretion system ATPase  72.99 
 
 
572 aa  786    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.32 
 
 
596 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  40.29 
 
 
574 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.81 
 
 
591 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.3 
 
 
585 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  40.4 
 
 
580 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  37.73 
 
 
578 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  37.73 
 
 
578 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.82 
 
 
585 aa  359  8e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  35.61 
 
 
581 aa  358  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.57 
 
 
584 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  37.18 
 
 
578 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  39.42 
 
 
593 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  40.15 
 
 
580 aa  352  8.999999999999999e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  39.45 
 
 
572 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  38.45 
 
 
591 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  38.27 
 
 
603 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  38.48 
 
 
619 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  35.7 
 
 
576 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  38.69 
 
 
593 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.12 
 
 
582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  37.79 
 
 
588 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  35.27 
 
 
590 aa  341  2e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.05 
 
 
598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.36 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  34.29 
 
 
577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  39.15 
 
 
663 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  36.23 
 
 
589 aa  335  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.99 
 
 
592 aa  334  3e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  35.73 
 
 
583 aa  332  9e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 
643 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  38.46 
 
 
668 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  36.25 
 
 
570 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  34.81 
 
 
535 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.6 
 
 
570 aa  329  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.71 
 
 
595 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  39.32 
 
 
579 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.68 
 
 
671 aa  327  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  38.32 
 
 
587 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  37.39 
 
 
742 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  37.45 
 
 
588 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  37.04 
 
 
573 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  35.65 
 
 
573 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  34.25 
 
 
602 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  34.46 
 
 
602 aa  323  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  36.31 
 
 
589 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.24 
 
 
560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  34.08 
 
 
602 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  37.23 
 
 
582 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  36.35 
 
 
587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  37.14 
 
 
581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.97 
 
 
583 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  38.5 
 
 
587 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  39.53 
 
 
575 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  36.46 
 
 
591 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  36.52 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.55 
 
 
667 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  38.11 
 
 
575 aa  310  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  35.46 
 
 
577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  36.72 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  36 
 
 
588 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.41 
 
 
593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  34.38 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  35.13 
 
 
583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  38.17 
 
 
614 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  35.5 
 
 
573 aa  302  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  34.68 
 
 
573 aa  302  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  34.17 
 
 
588 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  34.81 
 
 
589 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  38.42 
 
 
587 aa  301  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  36.75 
 
 
782 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  37.22 
 
 
764 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  33.76 
 
 
579 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  35.91 
 
 
581 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  35.95 
 
 
598 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  35.84 
 
 
578 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  37.81 
 
 
595 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  35.84 
 
 
600 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  36.04 
 
 
603 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  35.54 
 
 
578 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  37.81 
 
 
596 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  33.08 
 
 
566 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  37.25 
 
 
576 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  36.04 
 
 
582 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  35.57 
 
 
578 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.6 
 
 
574 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  36.75 
 
 
598 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  34.58 
 
 
582 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  32.85 
 
 
563 aa  287  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  34.58 
 
 
582 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  36.04 
 
 
574 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  34.77 
 
 
588 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  34.41 
 
 
588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2781  type I secretion system ATPase  36.54 
 
 
573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.333574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1119  ABC protein exporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.54 
 
 
573 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  36.78 
 
 
575 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  35.5 
 
 
598 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>