234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3957 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  63.43 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  62.72 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  57.89 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  52.71 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  50.9 
 
 		 278 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  49.82 
 
 		 289 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  53.26 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  50.72 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  53.41 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  53.03 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  51.52 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  53.75 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  54.55 
 
 		 276 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  51.66 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  49.26 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  44.53 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  42.75 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  43.44 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  45.64 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  45.23 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  43.09 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.88 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  30.74 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  29.21 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  31.12 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  27.31 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.31 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  28.31 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.73 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  28.42 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  28.36 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  29.09 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  28.14 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  26.91 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  31.23 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  31.11 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  32.5 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  31.23 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  26.83 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.22 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  30.48 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.14 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.85 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.37 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  28.27 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  27.86 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  30.48 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  28.23 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  28.37 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  29.69 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  28.68 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  27.96 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  26.62 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  27.88 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  29.82 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  23.91 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  27.14 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  27.21 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  29.29 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  29 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  28.03 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  29.55 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  29.67 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  26.18 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  27.48 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  27.21 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  26.18 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  26.01 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  26.64 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  28.1 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  26.71 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  26.16 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  27.33 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  25.91 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  25.27 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  27.57 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  26.95 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  27.96 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  27.8 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  29.31 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  28.33 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3954  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3841  protein of unknown function DUF849  25.16 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.839397  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  27.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  25.35 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  27.45 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  27.97 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  27.3 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4715  hypothetical protein  25.88 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  27.21 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>