230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5149 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5149  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
277 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4505  hypothetical protein  88.09 
 
 
277 aa  440  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3667  protein of unknown function DUF849  56.97 
 
 
278 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0083  hypothetical protein  60.08 
 
 
281 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187348  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3344  protein of unknown function DUF849  56.57 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0345  hypothetical protein  53.31 
 
 
289 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0994863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5967  hypothetical protein  51.14 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3957  hypothetical protein  50.72 
 
 
286 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4047  hypothetical protein  51.48 
 
 
285 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0174  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0513  hypothetical protein  51.89 
 
 
302 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0164851  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4735  hypothetical protein  50.2 
 
 
275 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3856  hypothetical protein  49.41 
 
 
285 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1418  protein of unknown function DUF849  51.29 
 
 
285 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1257  hypothetical protein  50.55 
 
 
285 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.305303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004321  hypothetical protein  44.36 
 
 
279 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1207  protein of unknown function DUF849  51.66 
 
 
276 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223998  normal  0.447863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01096  hypothetical protein  44.92 
 
 
281 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0160  hypothetical protein  48.46 
 
 
270 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3479  hypothetical protein  52.26 
 
 
264 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805186  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3804  hypothetical protein  50 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3684  aminotransferase class-III  49.6 
 
 
266 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  34.75 
 
 
273 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.29 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  32.26 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  27.36 
 
 
296 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  31.65 
 
 
294 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  31.65 
 
 
294 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  28.52 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  31.85 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.4 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0285  hypothetical protein  29.77 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  32.98 
 
 
281 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  30.03 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  27.14 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  31.03 
 
 
281 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.94 
 
 
303 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  26.14 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  31.54 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  31.37 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  30.18 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  32.38 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.61 
 
 
294 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  29.55 
 
 
310 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  30.28 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  30.47 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.14 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  30.17 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  30.95 
 
 
296 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  30.07 
 
 
293 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  28.52 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  30.39 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  33.57 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  28.52 
 
 
309 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  31.56 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  29.08 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  30.28 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  29.73 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  34.53 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  27.76 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  32.86 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  28.67 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  29.97 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  27.92 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  27.39 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.28 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  28.81 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  28.52 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  27.97 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  30.59 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  29.54 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  26.38 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  28.1 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  26.91 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  29.93 
 
 
311 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  26.38 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  27.69 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  28.47 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1894  hypothetical protein  29.49 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  27.87 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  29.93 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  27.85 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  28.8 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  25.82 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  28.76 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  27.39 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  31 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  27.87 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  27.1 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  32.73 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  27.65 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  29.9 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  32.73 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  29.28 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>