231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0966 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  84.19 
 
 
310 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  84.19 
 
 
310 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  81.29 
 
 
310 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  83.87 
 
 
310 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  84.19 
 
 
310 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  83.23 
 
 
310 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  83.23 
 
 
310 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  80.97 
 
 
310 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  80.97 
 
 
310 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  81.29 
 
 
310 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  80.32 
 
 
310 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  80.65 
 
 
310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  71.43 
 
 
314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  70.16 
 
 
307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  70.32 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  72.9 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  70.13 
 
 
309 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  70.13 
 
 
309 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  65.26 
 
 
321 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  64.59 
 
 
334 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  65.8 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  66.23 
 
 
309 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  66.45 
 
 
309 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  64.26 
 
 
311 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  64.31 
 
 
310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  63.99 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  57.74 
 
 
310 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  57.93 
 
 
312 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  63.82 
 
 
310 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  59.03 
 
 
310 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  64.88 
 
 
311 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  62.46 
 
 
315 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  59.35 
 
 
310 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  59.74 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  60.78 
 
 
312 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  58.12 
 
 
309 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  58.44 
 
 
309 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  57.19 
 
 
308 aa  348  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  57.52 
 
 
306 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  56.86 
 
 
306 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  55.92 
 
 
309 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  55.92 
 
 
311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  55.66 
 
 
313 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  57.88 
 
 
311 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  55.37 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  56.59 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  45.42 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  44.01 
 
 
310 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  43.69 
 
 
310 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.42 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  38.87 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  75.97 
 
 
129 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  35.23 
 
 
273 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.68 
 
 
296 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.67 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  36.16 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  32.81 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.62 
 
 
272 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.62 
 
 
272 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.62 
 
 
272 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.78 
 
 
273 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.22 
 
 
289 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  32.4 
 
 
293 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.44 
 
 
275 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  32.81 
 
 
297 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.12 
 
 
287 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.36 
 
 
311 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  33.65 
 
 
295 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.65 
 
 
304 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  31.96 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.13 
 
 
292 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  32.78 
 
 
321 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.92 
 
 
301 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  32.7 
 
 
295 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.11 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  62.7 
 
 
128 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  30.72 
 
 
298 aa  146  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  35.03 
 
 
295 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  33.96 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  33.96 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  33.96 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  33.96 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  34.28 
 
 
309 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  33.54 
 
 
294 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.67 
 
 
271 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>