233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0471 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  60.59 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  61.49 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  60.06 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  60.59 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  58.63 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  59.93 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  56.82 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  56.96 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  58.96 
 
 		 315 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  55.37 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  60.59 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  62.42 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  55.48 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  56.03 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  55.7 
 
 		 321 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  57.33 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  56.03 
 
 		 314 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  55.37 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  55.05 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  55.05 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  56.82 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  56.82 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  56.82 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  56.49 
 
 		 310 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  56.17 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  56.17 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  54.4 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  54.4 
 
 		 310 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  55.66 
 
 		 308 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  56.03 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  56.35 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  56.17 
 
 		 313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  54.25 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  52.44 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  56.03 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  53.42 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  49.84 
 
 		 310 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.37 
 
 		 306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  51.96 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  54.34 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  54 
 
 		 309 aa  318  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  54.07 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  52.56 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  53.42 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  53.75 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  54.07 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  54.4 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  54.07 
 
 		 309 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  52.79 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  51.16 
 
 		 310 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  47.71 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  48.21 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.57 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  35.83 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  36.45 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  35.57 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.54 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  34.69 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  37.69 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  37.62 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.06 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.75 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  36.45 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.23 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  33.77 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  36.14 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.11 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.75 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.59 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.07 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.39 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  33.94 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  33.94 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  33.94 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  32.73 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  35.74 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  36.14 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  33.75 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  34 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.11 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  33.86 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.22 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.66 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  35.49 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  31.15 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.22 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  34.75 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  30.94 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  34.06 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  36.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.88 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.88 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  35.85 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  36.34 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  34.86 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  34.95 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>