231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5054 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  72.88 
 
 		 308 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  68.18 
 
 		 310 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  69.48 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  59.42 
 
 		 312 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  61.61 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  63.75 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  63.55 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  63.93 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  61.17 
 
 		 309 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  58.58 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  57.79 
 
 		 310 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  60.65 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  60.32 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  59.42 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  58.5 
 
 		 310 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  55.66 
 
 		 310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  56.03 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  60.38 
 
 		 314 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  56.37 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  58.77 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  58.44 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  58.44 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  58.12 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  58.12 
 
 		 310 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  56.49 
 
 		 308 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  59.93 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  57.33 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  56.03 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  58.2 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  58.2 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  58.2 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  57.88 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  57.56 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  61.22 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  57.56 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  59.22 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  55.52 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  56.17 
 
 		 309 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  52.73 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  54.85 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  54.75 
 
 		 310 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  53.75 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  55.7 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  54.4 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.37 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  54.55 
 
 		 310 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  55.31 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  52.75 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  53.7 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  51.99 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  50.33 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  49.35 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  49.03 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  47.18 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.22 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.8 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  35.67 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.48 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  35.31 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  35.31 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  35.31 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  32.92 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.76 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  35.31 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.99 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35.31 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.42 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  35.08 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.44 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  35.12 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  36.59 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.67 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.06 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  36.05 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  35.76 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  38.65 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  34.97 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  38.12 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  36.48 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  35.19 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  33.02 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  31.13 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.55 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.67 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  36.09 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.75 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  36.05 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  34.77 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  32.92 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  35.74 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.01 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  35.42 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  33.85 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  34.05 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  35.42 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  35.42 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  35.42 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>