231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2361 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  614  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  61.95 
 
 
297 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  61.62 
 
 
297 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  64.04 
 
 
293 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  60.07 
 
 
293 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  53.58 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  52.22 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  52.22 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  52.22 
 
 
294 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  52.74 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  52.74 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  47.06 
 
 
290 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  52.74 
 
 
309 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  52.4 
 
 
309 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  53.08 
 
 
309 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  52.4 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  51.71 
 
 
312 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  52.74 
 
 
309 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  52.4 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  51.71 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  52.05 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  52.4 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  52.56 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  52.56 
 
 
294 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  51.7 
 
 
294 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  51.37 
 
 
309 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  47.81 
 
 
311 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  47.24 
 
 
293 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  48.28 
 
 
295 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  48.97 
 
 
299 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  45.27 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  46.42 
 
 
301 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  46.42 
 
 
295 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  46.08 
 
 
300 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  44.71 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  45.58 
 
 
305 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  44.71 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  46.08 
 
 
305 aa  235  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  39.52 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  43.45 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  44.37 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  42.86 
 
 
296 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  43.25 
 
 
294 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  39.37 
 
 
304 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  40.83 
 
 
311 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  39.18 
 
 
275 aa  202  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.23 
 
 
273 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.24 
 
 
289 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  38.81 
 
 
281 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.31 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  36.93 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  36.68 
 
 
273 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.12 
 
 
310 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.86 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.52 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  32.92 
 
 
313 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.27 
 
 
272 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  31.03 
 
 
308 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  33.45 
 
 
273 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  33.96 
 
 
312 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  36.49 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  36.15 
 
 
274 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  34.06 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  37.25 
 
 
274 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  33.64 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  33.64 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  30.72 
 
 
310 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  33.91 
 
 
272 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  34.56 
 
 
308 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.99 
 
 
321 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
280 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  33.68 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.98 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  29.34 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.44 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  31.35 
 
 
308 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  30.04 
 
 
449 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  32.21 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  30.63 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  30.79 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  30.79 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  28.82 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  30.09 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  31.41 
 
 
306 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  30.48 
 
 
453 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  32.13 
 
 
287 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  30.06 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  30.77 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>