241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5229 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5229  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  91.97 
 
 
274 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  91.61 
 
 
274 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  69.96 
 
 
280 aa  387  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  70.22 
 
 
281 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1332  hypothetical protein  70.48 
 
 
279 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235755  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4653  hypothetical protein  70.59 
 
 
283 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  69.85 
 
 
280 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1354  hypothetical protein  67.78 
 
 
278 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.291809  normal  0.536847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1554  protein of unknown function DUF849  66.42 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  55.72 
 
 
280 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  53.68 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  54.04 
 
 
283 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1631  hypothetical protein  53.48 
 
 
274 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  52.21 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6352  protein of unknown function DUF849  52.57 
 
 
274 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0556  hypothetical protein  50.93 
 
 
277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.316329 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  52.55 
 
 
277 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  50.55 
 
 
281 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  41.03 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  39.64 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.91 
 
 
273 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.89 
 
 
272 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.41 
 
 
272 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  34.55 
 
 
273 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  38.1 
 
 
272 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  39.03 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.43 
 
 
272 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.91 
 
 
289 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.18 
 
 
303 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  38.13 
 
 
298 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  38.83 
 
 
291 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  38.36 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  39.31 
 
 
295 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  38.49 
 
 
311 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  36.53 
 
 
272 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  36.67 
 
 
280 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.29 
 
 
287 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  38.49 
 
 
281 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.64 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  38.05 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  37.04 
 
 
276 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  36.76 
 
 
280 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  36.91 
 
 
297 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  37.88 
 
 
309 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  33.45 
 
 
293 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  37.54 
 
 
309 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  34.52 
 
 
293 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  37.2 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  36.96 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.28 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  36.18 
 
 
312 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  35.84 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  36.82 
 
 
272 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  35.77 
 
 
282 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  36.05 
 
 
294 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  37.59 
 
 
293 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  35.49 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  35.49 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  35.49 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  35.15 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  36.18 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  33.69 
 
 
453 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  35.84 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  35.84 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  34.56 
 
 
297 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  32.13 
 
 
449 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  35.23 
 
 
294 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  33.57 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  34.9 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.9 
 
 
294 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  35.84 
 
 
295 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  35.49 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  36.52 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  35.52 
 
 
296 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  35.15 
 
 
309 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  35.15 
 
 
309 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  34.81 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  33.89 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  34.81 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  34.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  34.81 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  32.41 
 
 
292 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  34.81 
 
 
309 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  36.79 
 
 
295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  35.84 
 
 
294 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  35.71 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2778  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.47 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  35.93 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  33.94 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2814  hypothetical protein  30.48 
 
 
290 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  35.71 
 
 
299 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  35.23 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  32.4 
 
 
316 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  36.24 
 
 
305 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>