234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2917 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  95.59 
 
 
295 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  87.07 
 
 
294 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  86.05 
 
 
294 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  86.05 
 
 
294 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  85.71 
 
 
294 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  80.27 
 
 
294 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  80.61 
 
 
294 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  80.61 
 
 
294 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  80.74 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  80.07 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  80.41 
 
 
309 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  80.07 
 
 
309 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  79.39 
 
 
309 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  80.41 
 
 
312 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  78.38 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  67.35 
 
 
299 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  60.68 
 
 
295 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  63.01 
 
 
297 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  65.41 
 
 
295 aa  362  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  60.47 
 
 
300 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  60.27 
 
 
297 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  60.47 
 
 
300 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  58.78 
 
 
300 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  58.78 
 
 
303 aa  349  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  59.12 
 
 
305 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  59.26 
 
 
293 aa  346  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  60.14 
 
 
305 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  58.16 
 
 
301 aa  345  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  57.19 
 
 
290 aa  332  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  56.1 
 
 
293 aa  308  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  53.04 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  52.4 
 
 
298 aa  300  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  52.7 
 
 
311 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.7 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  51.85 
 
 
295 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  46.42 
 
 
292 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  48.46 
 
 
291 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  44.44 
 
 
296 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  46.21 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  41.78 
 
 
304 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  44.14 
 
 
311 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.68 
 
 
289 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  38.85 
 
 
281 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.49 
 
 
273 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.4 
 
 
275 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  39.38 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.02 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.62 
 
 
271 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  36.08 
 
 
282 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  33.65 
 
 
310 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  37.24 
 
 
293 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.73 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 
272 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.96 
 
 
310 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  38.99 
 
 
309 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.71 
 
 
272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  33.96 
 
 
334 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.33 
 
 
321 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.84 
 
 
272 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  31.97 
 
 
312 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  36.51 
 
 
309 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  32.38 
 
 
310 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  34.59 
 
 
311 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  33.12 
 
 
310 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  34.6 
 
 
310 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  34.15 
 
 
309 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  35.14 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  37.38 
 
 
308 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  33.79 
 
 
293 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.5 
 
 
306 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  35.2 
 
 
310 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  34.17 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  34.39 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  33.97 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.65 
 
 
453 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  31.06 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  34.92 
 
 
309 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.78 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  32.09 
 
 
310 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.23 
 
 
308 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  34.17 
 
 
310 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  32.87 
 
 
272 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.48 
 
 
272 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  32.9 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  34.8 
 
 
308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  33.65 
 
 
310 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>