243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0359 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  69.34 
 
 
296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  68.62 
 
 
311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  67.93 
 
 
294 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  67.24 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  64.46 
 
 
304 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  52.4 
 
 
293 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  52.58 
 
 
311 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  52.4 
 
 
295 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  50.52 
 
 
293 aa  285  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  46.21 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  43.99 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  46.26 
 
 
297 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  44.33 
 
 
297 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  45.73 
 
 
294 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  48.81 
 
 
309 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  45.73 
 
 
294 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  46.76 
 
 
294 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  45.73 
 
 
294 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  48.46 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  48.46 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  48.46 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  47.78 
 
 
309 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  48.14 
 
 
309 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  47.8 
 
 
309 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  47.8 
 
 
309 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  47.8 
 
 
309 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  47.8 
 
 
309 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  47.46 
 
 
309 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  47.46 
 
 
309 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  47.78 
 
 
309 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  47.46 
 
 
309 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  47.78 
 
 
309 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  47.78 
 
 
309 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  46.78 
 
 
294 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  47.78 
 
 
299 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  47.1 
 
 
309 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  46.78 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  46.76 
 
 
312 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  46.76 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  46.76 
 
 
295 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  46.42 
 
 
294 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  43.79 
 
 
293 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  46.42 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  39.52 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  45.21 
 
 
295 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  44.37 
 
 
295 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  44.22 
 
 
303 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  41.98 
 
 
301 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.89 
 
 
273 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  42.86 
 
 
305 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  42.18 
 
 
300 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  42.71 
 
 
305 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  41.84 
 
 
300 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  41.84 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  38.06 
 
 
275 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.38 
 
 
289 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.07 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.52 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.52 
 
 
272 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  37.59 
 
 
272 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.17 
 
 
272 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.86 
 
 
272 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  34.19 
 
 
310 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  36.14 
 
 
272 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  33.22 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.89 
 
 
287 aa  165  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  32.59 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  33.56 
 
 
282 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  34.39 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.9 
 
 
281 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  30.79 
 
 
310 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  35.49 
 
 
272 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  32 
 
 
296 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  35.65 
 
 
309 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  35.33 
 
 
309 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.09 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  34.6 
 
 
306 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  33.78 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  35.53 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.75 
 
 
271 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  34.91 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  34.49 
 
 
314 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  31.13 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  35.02 
 
 
310 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.02 
 
 
308 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  31.96 
 
 
334 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  32.06 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  33.33 
 
 
449 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  31.43 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.15 
 
 
305 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  30.03 
 
 
293 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  32.91 
 
 
311 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  31.96 
 
 
310 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.4 
 
 
453 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  32.92 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  31.13 
 
 
313 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  32.19 
 
 
293 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  33.75 
 
 
310 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>