239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1340 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  75.85 
 
 
295 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  69.52 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  69.52 
 
 
309 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  69.52 
 
 
309 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  65.99 
 
 
294 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  69.18 
 
 
309 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  65.65 
 
 
294 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  68.84 
 
 
309 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  68.84 
 
 
309 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  64.97 
 
 
294 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  68.49 
 
 
309 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  65.31 
 
 
294 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  68.49 
 
 
309 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  68.84 
 
 
309 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  68.84 
 
 
309 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  68.15 
 
 
309 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  67.81 
 
 
312 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  66.78 
 
 
309 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  67.35 
 
 
295 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  68.15 
 
 
295 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  65.31 
 
 
294 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  65.87 
 
 
294 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  65.53 
 
 
294 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  58.16 
 
 
295 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  57.63 
 
 
300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  56.19 
 
 
300 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  58.5 
 
 
293 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  55.15 
 
 
303 aa  331  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  56.61 
 
 
300 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  55.97 
 
 
297 aa  328  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  54.95 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  57.24 
 
 
301 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  54.55 
 
 
290 aa  324  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  54.49 
 
 
305 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  54.15 
 
 
305 aa  315  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  53.2 
 
 
297 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  49.48 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  48.97 
 
 
298 aa  281  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  51.03 
 
 
293 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  51.35 
 
 
311 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  47.78 
 
 
292 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50.87 
 
 
295 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  47.4 
 
 
296 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  48.29 
 
 
291 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  47.26 
 
 
294 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  46.23 
 
 
311 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  44.98 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.08 
 
 
289 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.08 
 
 
275 aa  188  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  37.8 
 
 
273 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  37 
 
 
312 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.08 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  35.42 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.54 
 
 
272 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.2 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.79 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.29 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.2 
 
 
272 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.96 
 
 
310 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  36.36 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  35.52 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  35.93 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  38.41 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  35.25 
 
 
293 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  31.49 
 
 
273 aa  158  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  36.02 
 
 
310 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  36.09 
 
 
313 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  32.65 
 
 
272 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  34.3 
 
 
316 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.99 
 
 
453 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  34.38 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  34.38 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.36 
 
 
296 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.75 
 
 
306 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  36.42 
 
 
312 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  34.01 
 
 
287 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  35.54 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  35.67 
 
 
310 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  35 
 
 
309 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  36.36 
 
 
309 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  33.13 
 
 
309 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  32.91 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  34.78 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  36.28 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  31.68 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  32.61 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  34.1 
 
 
288 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  33.77 
 
 
288 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  34.48 
 
 
310 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  32.19 
 
 
309 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>