240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  75.85 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  68.37 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  68.03 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  67.35 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  68.03 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  68.03 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  68.03 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  67.81 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  67.81 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  67.69 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  63.82 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  67.47 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  63.48 
 
 		 294 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  67.47 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  67.69 
 
 		 309 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  67.81 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  63.82 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  67.81 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  63.82 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  67.47 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  67.81 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  67.47 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  65.65 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  66.33 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  65.41 
 
 		 295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  65.75 
 
 		 295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  64.16 
 
 		 294 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  63.82 
 
 		 294 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  63.48 
 
 		 294 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  58.9 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  58.22 
 
 		 297 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  56.36 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  57.68 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  59.25 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  58.5 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  58.84 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  56.66 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  57.48 
 
 		 300 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  56.66 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  56.9 
 
 		 301 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  56.8 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  52.04 
 
 		 297 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  50.68 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  51.71 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  50.17 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  50.51 
 
 		 311 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  52.05 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  45.21 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  45.33 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  45.21 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  45.21 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  43.3 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  45.21 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  40.89 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.59 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  37.24 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.83 
 
 		 273 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  35.29 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.93 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  36.21 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  35.71 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  33.91 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  37.12 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  34.83 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  38.38 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.88 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  37.24 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.54 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.52 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  37.54 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  36.02 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.69 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.16 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  33.79 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  35.41 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  33.1 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  34.13 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  34.43 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  35.24 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  33.77 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  37.15 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  35.11 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  32.92 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.12 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  33.55 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  33.9 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.02 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  33.75 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.38 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  31.75 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  34.9 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  32.19 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1153  hypothetical protein  34.73 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2933  hypothetical protein  34.73 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5151  protein of unknown function DUF849  37.97 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4686  hypothetical protein  37.97 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  0.972452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>