237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3295 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  82.45 
 
 		 303 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  82.18 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  75.67 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  75.33 
 
 		 300 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  75 
 
 		 300 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  65 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  65.2 
 
 		 295 aa  394  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  58.78 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  59.12 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  58.78 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  58.78 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  59.6 
 
 		 295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  58.92 
 
 		 295 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  58.78 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  57.91 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  56.9 
 
 		 309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  56.9 
 
 		 309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  57.24 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  56.42 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  56.42 
 
 		 294 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  57.24 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  57.58 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  57.24 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  56.9 
 
 		 309 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  56.9 
 
 		 309 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  56.9 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  57.24 
 
 		 309 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  56.9 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  56.57 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  56.23 
 
 		 312 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  54.15 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  52.2 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  56.66 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  51.88 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  52.22 
 
 		 297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  52.53 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  45.87 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  47.28 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  46.08 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  48.15 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  47.99 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  43.34 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  42.91 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  42.86 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  44.41 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  42.37 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.1 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  37.58 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  37.71 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  35.25 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.21 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  32.07 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  33.22 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  31 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  36.95 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  35.86 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  31.4 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  33.85 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  33.56 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  33.75 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  33.56 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  33.75 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  34.91 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  35.26 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  34.67 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  32.42 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.59 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.59 
 
 		 272 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.59 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  32.29 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  32.51 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  32.61 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  34.28 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  33.23 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  32.93 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  35.19 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  31.78 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  33.44 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  34.55 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  34.46 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  34.37 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  33.75 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  30.28 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  32.13 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  33.02 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.72 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.02 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  32.99 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.11 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  34.06 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>