237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2185 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  74.52 
 
 
310 aa  457  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  72.55 
 
 
308 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  71.71 
 
 
309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  70.92 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  68.09 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  69.41 
 
 
311 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  70.26 
 
 
309 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  61.94 
 
 
310 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  67.74 
 
 
310 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  63.23 
 
 
310 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  65.03 
 
 
321 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  66.45 
 
 
310 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  66.01 
 
 
314 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  65.81 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  65.48 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  66.77 
 
 
310 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  64.8 
 
 
307 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  67.74 
 
 
310 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  66.13 
 
 
310 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  67.1 
 
 
309 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  63.34 
 
 
310 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  56.13 
 
 
310 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  62.06 
 
 
310 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  60.97 
 
 
310 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  57.93 
 
 
312 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  61.67 
 
 
311 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  61.51 
 
 
310 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  59.87 
 
 
312 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  55.81 
 
 
310 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  59.67 
 
 
308 aa  360  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  61.04 
 
 
315 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  56.91 
 
 
309 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  57.05 
 
 
309 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  56.49 
 
 
310 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  56.59 
 
 
311 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  56.68 
 
 
309 aa  341  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  53.23 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  56.91 
 
 
311 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  54.75 
 
 
313 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  54.34 
 
 
309 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  52.94 
 
 
306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  52.29 
 
 
306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  54.98 
 
 
310 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  44.92 
 
 
326 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  44.16 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  43.51 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  39.73 
 
 
273 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  37.01 
 
 
296 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.09 
 
 
289 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  38.72 
 
 
308 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  34.19 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  36.68 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  37.14 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.69 
 
 
305 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  36.39 
 
 
287 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  37.04 
 
 
301 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  36.09 
 
 
275 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  37.3 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.45 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  34.59 
 
 
297 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.51 
 
 
272 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  35.44 
 
 
294 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35.13 
 
 
294 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  38.85 
 
 
272 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  38.72 
 
 
272 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  35.44 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  35.44 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  38.51 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.45 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.33 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.58 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  34.8 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  34.34 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  71.32 
 
 
129 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  37.03 
 
 
294 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33.33 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  35.56 
 
 
295 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  37.78 
 
 
309 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  37.46 
 
 
309 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  36.39 
 
 
294 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  37.14 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  37.14 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  36.39 
 
 
294 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  37.14 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  37.46 
 
 
309 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  33.54 
 
 
300 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.23 
 
 
290 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  34.8 
 
 
300 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  36.51 
 
 
312 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  37.14 
 
 
309 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  36.19 
 
 
309 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>